フーシャ村
時は大海賊時代。いまや伝説の海賊王 ゴールド・ロジャーの残した『ひとつなぎの大秘宝（ワンピース）』をめぐって幾人もの海賊たちが旗を掲げ戦っていた。そして そんな海賊に憧れる一人の少年がいた。その名はルフィ。 村に滞在する赤髪海賊団のリーダー・シャンクスを慕うルフィだったが ある日シャンクス達の戦利品『悪魔の実』を食べてしまう その実の能力により 一生泳げない体の変わりに全身がゴムの様にのびる体を手に入れた だがその直後 シャンクス達と敵対する山賊団の怒りを買い 囚われの身となったルフィは 海の真中に 投げ込まれてしまう
溺れるルフィを海獣が襲わんとした瞬間ルフィを救ったのは シャンクスだった！ その左腕と引き換えに・・・・。
それから１０年 シャンクスから受け継いだ麦わら帽をトレードマークに ルフィは一人航海に出る 海賊王を目指しての旅が始まった
海軍基地の町
仲間を求めるルフィは大渦に巻き込まれ遭難 流れ着いた島で イカついおばさん『金棒のアルビダ』に捕まっていた 海軍将校を目指す『コビー』に出会う コビーに生き様を見せ アルビダをぶっ飛ばした ルフィはコビーと二人で海軍基地の町に上陸 そこで 磔にされた『海賊狩りのゾロ』と出会う
悪名高き海軍将校『斧手のモーガン』を倒し ゾロを助け出し新たな仲間にし そこでコビーと別れ 『偉大なる航路（グランドライン）』へ向かった しかしその途中ルフィは鳥に連れられはなればなれに・・・ 船上に残ったゾロは遭難者・海賊バギーの一味を救う
その頃 ある町にたどり着いたルフィは バギー団に襲われる海賊専門の泥棒『ナミ』と出会い争いに巻き込まれてしまう しかし グランドラインの海図がバギーの手中にあることと ナミが優れた航海術を持っていると知ったルフィはバギー団と戦うことを決意 ゾロとともに バギー団のモージとカバジを倒し ついにバギーと向き合った しかし バギーも悪魔の実の能力者だった
ナミとの共同作戦でバギーをぶっ飛ばすことに成功 バギー達の宝の半分を襲われた町の修復費用において島を出る
シロップ村
グランドラインを目指すため強力な船と食料を求め とある村で下船するがそこで誇り高きうそつき 『ウソップ』と知り合う 彼はいつもウソをついて村中騒がせていたが 病気がちのカヤを励ます心優しき若者だった ある日 ルフィとウソップは偶然 カヤの従順な執事クラハドールが 悪名高き海賊キャプテン クロであることを知ってしまう そして海賊団に襲わせカヤを殺し財産を手に入れようと企んでいることも・・・ウソップの村を思う気持ちにうたれたルフィ達はクロ率いるクロネコ海賊団と戦うことを決意 村へ通じる坂道での熾烈な戦い そしてクロ自ら攻撃を仕掛けてくるがぶっ飛ばすことに成功 村の平和は守られた ウソップを仲間に入れ 自分たちの船ゴーイング・メリー号を手に入れた
海上レストラン バラティｴ
次の目的 海のコック探しへと旅立ったルフィ達 途中 賞金稼ぎユニット『ヨサク＆ジョニ―』から 『海上レストラン』の存在を知り 船は一路北へ 到着したのも束の間 またもトラブルに巻き込まれルフィはレストランで雑用係として働く事に・・・ そこで 海のコックに相応しい 『サンジ』と出会い心奪われる そこへ海賊艦隊を率いる『首領クリーク』が現れ この船を貰うと宣言 海上レストランを舞台に壮絶な戦いが始まった 身体をはって店を守るサンジ だがオーナー『ゼフ』を人質にとられ絶体絶命に・・・ そうまでして守ろうとするサンジの真意とは
９年前 まだ見習いコックだったサンジと海賊ゼフは突然の嵐に巻き込まれ岩山に漂着 ゼフはサンジを生かそうと 残り僅かな食料を全てあげ 自らの右足を食った そうまでして助けたゼフ それは自分と同じ夢を持っているからだった・・・・
大激闘の末 遂に向き合ったルフィとクリーク 死をも恐れぬ強い信念を持ち 真っ向勝負をルフィは壮絶な戦いに勝利し 力つきる・・・ 眠りから覚めたルフィは再度仲間になってくれと頼むが どうしてもＯＫしてくれなかった しかしゼフをはじめとするコック達は サンジに旅立ちを決意させるため 手荒い芝居を打つことに・・・ 暖かい仲間の行為に心打たれ サンジはルフィと行く事を決意 ４人目の仲間が誕生した
ココヤシ村
いよいよグランドラインへと思ったのも束の間 ナミが行方不明に・・・ ゾロとウソップは一足先にナミの行くへを追い 魚人が支配する町 アーロンパークへと辿り着く そこでナミの本当の姿を見て 驚愕するのだった 腕に刻まれた 海賊アーロン一味の刺青・・・
何も知らないルフィ達が島に到着し 聞かされる真実にも耳を傾けようとはしなかった しかし 義姉『ノジコ』から 最愛の母『ベルメール』がアーロンに殺された事実を聞かされ ナミがあんなにも海賊を嫌っていた理由が分かったのだった そして自分の村を助けるために金を集めていたことも・・・
一人孤独な戦いを続けるナミは ルフィに心から叫ぶのだった 『助けて・・・』と
ナミの心の叫びを聞いたルフィは 遂にアーロンと対峙するが海に落とされ大ピンチ！！
地上に残された仲間達はルフィを救おうと アーロンの部下達に決戦を挑み見事勝利 ルフィも救出され残すはアーロンのみとなった
ナミの心からの笑顔を取り戻すため アーロンとの頂上決戦に挑んだルフィ 怒りの一撃がアーロンパークもろとも吹き飛ばし ナミとココヤシ村のみんなに笑顔が戻った・・・・
ローグタウン
二人目？の仲間になったナミと共に ルフィ達は出航する その船上で 自分が見事賞金首になったことを知ったルフィは喜びを隠せない そしてグランドラインも間近 海賊王Ｇ・ロジャーが処刑された町 ローグタウンに立ち寄る 処刑台を見に行ったルフィは 台に登り偉大なる海賊王が見た景色を堪能していた その時 超美麗な姿に変身したアルビダとバギーが現れた ルフィを台の上で捕まえ 公開処刑が行われようとしたその瞬間 雷鳴が轟き ルフィは救われた 死の間際 ルフィの顔には笑みがあった あの海賊王Ｇ・ロジャーの最期と同じように・・・
グランドライン突入
ルフィ達は 不思議山？を駆け登り 遂にグランドラインへと突入した しかし目の前に巨大なクジラが現れて ルフィ達は胃の中へ飲みこまれてしまう・・・・そこで事件が起こった 謎の二人組み『Ｍｒ・ないん』 『ミス・ウェンズデー』がこのクジラを狙い 胃の中に侵入してきた ルフィは簡単に二人を捕まえ ここの住人クロッカスにクジラが何故この場所で待っているか聞く 事態を把握し足るフィは新たな目的をクジラに与えるため あえて戦いを挑み もう一度会いに来ると約束するのだった
ウィスキーピーク
行き先の決まっていなかったルフィ達は さっき捕まえた二人組みの住む町 ウィスキーピークを目指す 到着すると あまりの歓迎ぶりに皆酔い潰れてしまう 夜も更けた頃 ﾅにやらあやしい雰囲気が・・・ この町は賞金稼ぎの巣で一切を謎とする『Ｂ・Ｗ』（バロック・ワークス）と言う秘密犯罪会社が住む町だったのだ しかし その掟を 破り社長の素性を調べていた『裏切り者』がいた その人物とは 行方不明になっていたアラバスタ王国の王女『ビビ』（ミス・ウェンズデー）と護衛隊長・イガラム（Ｍｒ・８）だった 彼女達を始末するため送られて来た Ｂ・ＷオフィサーエージェントのＭｒ５とミス・バレンタイン 圧倒的な力を持つ彼等に捕まる寸前のビビを イガラムと密約を交わしたナミの命令により ゾロが助けに入る そして ビビからＢ・Ｗの真の目的『アラバスタ王国乗っ取り』と 黒幕王下七武海『クロコダイル』の話しを聞いてしまったルフィ達は Ｂ・Ｗに狙われる事が決定！！
リトルガーデン
ビビを故郷へ送り届けようと 航海を始めたるフィ達は巨人の住む島 リトルガーデンへ辿り着く ここでは男達の『誇り』を賭けた闘いが１００年も続いていた しかしＢ・Ｗがこの誇りを汚す
ゾロ達を捕まえるため 次々と卑劣な罠を仕掛けるＢ・Ｗ 怒ったルフィは Ｍｒ３との死闘に臨み 見事勝利する
ドラム王国
巨人島でＢ・Ｗとの激闘後 事態は急変した アラバスタ乗っ取り計画が本格化しだし 船を急いで出航させるが ナミが高熱にうなされる ナミの病気を診てもらう為 医者探しの旅に出るルフィ達は 雪の降りしきるドラム島に辿り着く この国はかつて海賊に襲われ 王は医者と共に国を捨てて逃げ出していた 現在残っている医者は『魔女』と呼ばれる医者『Ｄｒくれは』が一人いるだけだった この島の一番高い山の頂上にある城に住む『Ｄｒくれは』に 一刻も早くナミを診てもらいたいルフィ達は 頂上を目指す そこには青っ鼻のトナカイ『チョッパー』がいた ２足歩行で 喋るトナカイに興味を示すルフィは 彼を仲間に誘うが 彼の心には大きな傷があった
６年前 チョッパーに名を与え 息子と呼んだ やぶ医者『Ｄｒ ヒルルク』 誰からもバケモノ扱いを受けてきたチョッパーにとって 初めて優しくされたことは 嬉しい事であった ヒルルクは生まれた国を愛し ワポルが支配する腐った国の未来を救おうとしていた だがワポルの罠にかかり 自ら命を絶った 悲しくつらい 別れを経験したチョッパーだが ヒルルクの意志を継ぎ 医者を目指すことになった
チョッパーは 父 Ｄｒヒルルクの墓標を守るため この地から 離れられずにいた
その時 国を捨てたかつての王 『ワポル』達が帰ってきた ルフィは城に掲げられたヒルルクの墓標 『髑髏の旗』を汚すワポル達にキレる！！チョッパーは『合体チェスマリーモ』を撃破し ルフィはワポルを空の彼方へと消し去った 海賊の誇りと ルフィの熱意に感動したチョッパーは 海賊になることを決意し師であり 母 Ｄｒくれはを告げた
その夜ドラム島には 一人の男と新しい国の門出を祝う『ヒルルクの桜』 ピンク色の雪が降り続いた・・・
アラバスタ
チョッパーを仲間に加え アラバスタに到着したルフィ達 港町ナノハナで冒険の準備を整えていた所 『スモーカー大佐』率いる海軍部隊と遭遇し 命からがら町を脱出する 一刻も早く反乱軍を止めたいビビは 反乱軍の本拠地ユバヘ向かう 途中 枯れた町エルマルにおいて ビビの口から語られたアラバスタ国民の暴動の原因・・・・・ダンスパウダーと言う人工的に雨を降らせる粉を使い 国王と国民を対立させ アラバスタを乗っ取ろうとする恐ろしい計画だったのだ
過酷な砂漠を抜け 辿り着いた町ユバ そこは砂に埋もれ老人が一人いるだけ・・・ 愕然とするルフィ達に声をかける老人『トト』は 反乱軍の『リーダー・コーザ』の父で ビビとは知りあいだったのだ現在の国の情勢や 反乱軍とビビの関係を知ったルフィ それぞれの想いが交錯する中 ルフィは一つの結論を出す この暴動を止めるには 真っ先にクロコダイルをぶっ飛ばすことだと
ルフィ達は クロコダイルがいるレインベースへ進路をとる・・・
カルーから この反乱の黒幕がクロコダイルだと知った国王は 全兵をレインベースへと向ける準備を進める 一方Ｍｒ2にだまされ 首都アルバーナへと進行を開始する反乱軍 そして ルフィ達はクロコダイルの元へ辿り着いたものの 罠にかかり 囚われの身に・・・
